modules/chempy/protein_amber99.py (1,293 lines of code) (raw):

#A* ------------------------------------------------------------------- #B* This file contains source code for the PyMOL computer program #C* copyright 1998-2000 by Warren Lyford Delano of DeLano Scientific. #D* ------------------------------------------------------------------- #E* It is unlawful to modify or remove this copyright notice. #F* ------------------------------------------------------------------- #G* Please see the accompanying LICENSE file for further information. #H* ------------------------------------------------------------------- #I* Additional authors of this source file include: #-* #-* #-* #Z* ------------------------------------------------------------------- normal = { ('ALA' , '1HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0603 } , ('ALA' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0603 } , ('ALA' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0603 } , ('ALA' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('ALA' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0337 } , ('ALA' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1825 } , ('ALA' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('ALA' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0823 } , ('ALA' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('ALA' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('CYM' , '2HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.2440 } , ('CYM' , '3HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.2440 } , ('CYM' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6160 } , ('CYM' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0350 } , ('CYM' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.7360 } , ('CYM' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2520 } , ('CYM' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0480 } , ('CYM' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4630 } , ('CYM' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5040 } , ('CYM' , 'SG' ) : { 'type' : 'SH' , 'charge' : -0.7360 } , ('CYS' , '2HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1112 } , ('CYS' , '3HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1112 } , ('CYS' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('CYS' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0213 } , ('CYS' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1231 } , ('CYS' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('CYS' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1124 } , ('CYS' , 'HG' ) : { 'type' : 'HS' , 'charge' : 0.1933 } , ('CYS' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('CYS' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('CYS' , 'SG' ) : { 'type' : 'SH' , 'charge' : -0.3119 } , ('CYX' , '2HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0910 } , ('CYX' , '3HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0910 } , ('CYX' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('CYX' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0429 } , ('CYX' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0790 } , ('CYX' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('CYX' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0766 } , ('CYX' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('CYX' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('CYX' , 'SG' ) : { 'type' : 'S' , 'charge' : -0.1081 } , ('ASP' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0122 } , ('ASP' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0122 } , ('ASP' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5366 } , ('ASP' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0381 } , ('ASP' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0303 } , ('ASP' , 'CG' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7994 } , ('ASP' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2936 } , ('ASP' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0880 } , ('ASP' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.5163 } , ('ASP' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5819 } , ('ASP' , 'OD1' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8014 } , ('ASP' , 'OD2' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8014 } , ('ASH' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0488 } , ('ASH' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0488 } , ('ASH' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('ASH' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0341 } , ('ASH' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0316 } , ('ASH' , 'CG' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6462 } , ('ASH' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('ASH' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0864 } , ('ASH' , 'HD2' ) : { 'type' : 'HO' , 'charge' : 0.4747 } , ('ASH' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('ASH' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('ASH' , 'OD1' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5554 } , ('ASH' , 'OD2' ) : { 'type' : 'OH' , 'charge' : -0.6376 } , ('GLU' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0173 } , ('GLU' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0425 } , ('GLU' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0173 } , ('GLU' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0425 } , ('GLU' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5366 } , ('GLU' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0397 } , ('GLU' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0560 } , ('GLU' , 'CD' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8054 } , ('GLU' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0136 } , ('GLU' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2936 } , ('GLU' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1105 } , ('GLU' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.5163 } , ('GLU' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5819 } , ('GLU' , 'OE1' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8188 } , ('GLU' , 'OE2' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8188 } , ('GLP' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0256 } , ('GLP' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0430 } , ('GLP' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0256 } , ('GLP' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0430 } , ('GLP' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('GLP' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0145 } , ('GLP' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0071 } , ('GLP' , 'CD' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6801 } , ('GLP' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0174 } , ('GLP' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('GLP' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0779 } , ('GLP' , 'HE2' ) : { 'type' : 'HO' , 'charge' : 0.4641 } , ('GLP' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('GLP' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('GLP' , 'OE1' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5838 } , ('GLP' , 'OE2' ) : { 'type' : 'OH' , 'charge' : -0.6511 } , ('PHE' , '1HD' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1330 } , ('PHE' , '1HE' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1430 } , ('PHE' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0295 } , ('PHE' , '2HD' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1330 } , ('PHE' , '2HE' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1430 } , ('PHE' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0295 } , ('PHE' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('PHE' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0024 } , ('PHE' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0343 } , ('PHE' , 'CD1' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1256 } , ('PHE' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1256 } , ('PHE' , 'CE1' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1704 } , ('PHE' , 'CE2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1704 } , ('PHE' , 'CG' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : 0.0118 } , ('PHE' , 'CZ' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1072 } , ('PHE' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('PHE' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0978 } , ('PHE' , 'HZ' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1297 } , ('PHE' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('PHE' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('GLY' , '3HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0698 } , ('GLY' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('GLY' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0252 } , ('GLY' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('GLY' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0698 } , ('GLY' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('GLY' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('HIP' , '1HD' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3866 } , ('HIP' , '1HE' ) : { 'type' : 'H5' , 'charge' : 0.2681 } , ('HIP' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0810 } , ('HIP' , '2HD' ) : { 'type' : 'H4' , 'charge' : 0.2317 } , ('HIP' , '2HE' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3911 } , ('HIP' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0810 } , ('HIP' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7341 } , ('HIP' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1354 } , ('HIP' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0414 } , ('HIP' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CW' , 'charge' : -0.1141 } , ('HIP' , 'CE1' ) : { 'type' : 'CR' , 'charge' : -0.0170 } , ('HIP' , 'CG' ) : { 'type' : 'CC' , 'charge' : -0.0012 } , ('HIP' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2747 } , ('HIP' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1212 } , ('HIP' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3479 } , ('HIP' , 'ND1' ) : { 'type' : 'NA' , 'charge' : -0.1513 } , ('HIP' , 'NE2' ) : { 'type' : 'NA' , 'charge' : -0.1718 } , ('HIP' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5894 } , ('HIE' , '1HE' ) : { 'type' : 'H5' , 'charge' : 0.1435 } , ('HIE' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0367 } , ('HIE' , '2HD' ) : { 'type' : 'H4' , 'charge' : 0.1862 } , ('HIE' , '2HE' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3339 } , ('HIE' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0367 } , ('HIE' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('HIE' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0581 } , ('HIE' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0074 } , ('HIE' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CW' , 'charge' : -0.2207 } , ('HIE' , 'CE1' ) : { 'type' : 'CR' , 'charge' : 0.1635 } , ('HIE' , 'CG' ) : { 'type' : 'CC' , 'charge' : 0.1868 } , ('HIE' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('HIE' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1360 } , ('HIE' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('HIE' , 'ND1' ) : { 'type' : 'NB' , 'charge' : -0.5432 } , ('HIE' , 'NE2' ) : { 'type' : 'NA' , 'charge' : -0.2795 } , ('HIE' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('HID' , '1HD' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3649 } , ('HID' , '1HE' ) : { 'type' : 'H5' , 'charge' : 0.1392 } , ('HID' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0402 } , ('HID' , '2HD' ) : { 'type' : 'H4' , 'charge' : 0.1147 } , ('HID' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0402 } , ('HID' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('HID' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0188 } , ('HID' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0462 } , ('HID' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CV' , 'charge' : 0.1292 } , ('HID' , 'CE1' ) : { 'type' : 'CR' , 'charge' : 0.2057 } , ('HID' , 'CG' ) : { 'type' : 'CC' , 'charge' : -0.0266 } , ('HID' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('HID' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0881 } , ('HID' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('HID' , 'ND1' ) : { 'type' : 'NA' , 'charge' : -0.3811 } , ('HID' , 'NE2' ) : { 'type' : 'NB' , 'charge' : -0.5727 } , ('HID' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('ILE' , '1HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0186 } , ('ILE' , '1HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0882 } , ('ILE' , '2HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0186 } , ('ILE' , '2HG1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0236 } , ('ILE' , '2HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0882 } , ('ILE' , '3HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0186 } , ('ILE' , '3HG1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0236 } , ('ILE' , '3HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0882 } , ('ILE' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('ILE' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0597 } , ('ILE' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.1303 } , ('ILE' , 'CD1' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0660 } , ('ILE' , 'CG1' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0430 } , ('ILE' , 'CG2' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.3204 } , ('ILE' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('ILE' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0869 } , ('ILE' , 'HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0187 } , ('ILE' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('ILE' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('LYS' , '1HZ' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3400 } , ('LYS' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0362 } , ('LYS' , '2HD' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0621 } , ('LYS' , '2HE' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1135 } , ('LYS' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0103 } , ('LYS' , '2HZ' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3400 } , ('LYS' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0362 } , ('LYS' , '3HD' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0621 } , ('LYS' , '3HE' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1135 } , ('LYS' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0103 } , ('LYS' , '3HZ' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3400 } , ('LYS' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7341 } , ('LYS' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2400 } , ('LYS' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0094 } , ('LYS' , 'CD' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0479 } , ('LYS' , 'CE' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0143 } , ('LYS' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0187 } , ('LYS' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2747 } , ('LYS' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1426 } , ('LYS' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3479 } , ('LYS' , 'NZ' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : -0.3854 } , ('LYS' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5894 } , ('LEU' , '1HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1000 } , ('LEU' , '1HD2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1000 } , ('LEU' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0457 } , ('LEU' , '2HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1000 } , ('LEU' , '2HD2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1000 } , ('LEU' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0457 } , ('LEU' , '3HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1000 } , ('LEU' , '3HD2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1000 } , ('LEU' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('LEU' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0518 } , ('LEU' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1102 } , ('LEU' , 'CD1' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.4121 } , ('LEU' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.4121 } , ('LEU' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.3531 } , ('LEU' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('LEU' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0922 } , ('LEU' , 'HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0361 } , ('LEU' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('LEU' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('MET' , '1HE' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0684 } , ('MET' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0241 } , ('MET' , '2HE' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0684 } , ('MET' , '2HG' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0440 } , ('MET' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0241 } , ('MET' , '3HE' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0684 } , ('MET' , '3HG' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0440 } , ('MET' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('MET' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0237 } , ('MET' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0342 } , ('MET' , 'CE' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0536 } , ('MET' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0018 } , ('MET' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('MET' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0880 } , ('MET' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('MET' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('MET' , 'SD' ) : { 'type' : 'S' , 'charge' : -0.2737 } , ('ASN' , '1HD2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4196 } , ('ASN' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0797 } , ('ASN' , '2HD2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4196 } , ('ASN' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0797 } , ('ASN' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('ASN' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0143 } , ('ASN' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2041 } , ('ASN' , 'CG' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7130 } , ('ASN' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('ASN' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1048 } , ('ASN' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('ASN' , 'ND2' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.9191 } , ('ASN' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('ASN' , 'OD1' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5931 } , ('PRO' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0253 } , ('PRO' , '2HD' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0391 } , ('PRO' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0213 } , ('PRO' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0253 } , ('PRO' , '3HD' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0391 } , ('PRO' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0213 } , ('PRO' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5896 } , ('PRO' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0266 } , ('PRO' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0070 } , ('PRO' , 'CD' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0192 } , ('PRO' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0189 } , ('PRO' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0641 } , ('PRO' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.2548 } , ('PRO' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5748 } , ('GLN' , '1HE2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4251 } , ('GLN' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0171 } , ('GLN' , '2HE2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4251 } , ('GLN' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0352 } , ('GLN' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0171 } , ('GLN' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0352 } , ('GLN' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('GLN' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0031 } , ('GLN' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0036 } , ('GLN' , 'CD' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6951 } , ('GLN' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0645 } , ('GLN' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('GLN' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0850 } , ('GLN' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('GLN' , 'NE2' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.9407 } , ('GLN' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('GLN' , 'OE1' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.6086 } , ('ARG' , '1HH1' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4478 } , ('ARG' , '1HH2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4478 } , ('ARG' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0327 } , ('ARG' , '2HD' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0687 } , ('ARG' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0285 } , ('ARG' , '2HH1' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4478 } , ('ARG' , '2HH2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4478 } , ('ARG' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0327 } , ('ARG' , '3HD' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0687 } , ('ARG' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0285 } , ('ARG' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7341 } , ('ARG' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2637 } , ('ARG' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0007 } , ('ARG' , 'CD' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0486 } , ('ARG' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0390 } , ('ARG' , 'CZ' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : 0.8076 } , ('ARG' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2747 } , ('ARG' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1560 } , ('ARG' , 'HE' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3456 } , ('ARG' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3479 } , ('ARG' , 'NE' ) : { 'type' : 'N2' , 'charge' : -0.5295 } , ('ARG' , 'NH1' ) : { 'type' : 'N2' , 'charge' : -0.8627 } , ('ARG' , 'NH2' ) : { 'type' : 'N2' , 'charge' : -0.8627 } , ('ARG' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5894 } , ('SER' , '2HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0352 } , ('SER' , '3HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0352 } , ('SER' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('SER' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0249 } , ('SER' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.2117 } , ('SER' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('SER' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0843 } , ('SER' , 'HG' ) : { 'type' : 'HO' , 'charge' : 0.4275 } , ('SER' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('SER' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('SER' , 'OG' ) : { 'type' : 'OH' , 'charge' : -0.6546 } , ('THR' , '1HG' ) : { 'type' : 'HO' , 'charge' : 0.4102 } , ('THR' , '1HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0642 } , ('THR' , '2HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0642 } , ('THR' , '3HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0642 } , ('THR' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('THR' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0389 } , ('THR' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.3654 } , ('THR' , 'CG2' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2438 } , ('THR' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('THR' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1007 } , ('THR' , 'HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0043 } , ('THR' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('THR' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('THR' , 'OG1' ) : { 'type' : 'OH' , 'charge' : -0.6761 } , ('VAL' , '1HG1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0791 } , ('VAL' , '1HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0791 } , ('VAL' , '2HG1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0791 } , ('VAL' , '2HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0791 } , ('VAL' , '3HG1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0791 } , ('VAL' , '3HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0791 } , ('VAL' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('VAL' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0875 } , ('VAL' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.2985 } , ('VAL' , 'CG1' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.3192 } , ('VAL' , 'CG2' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.3192 } , ('VAL' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('VAL' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0969 } , ('VAL' , 'HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0297 } , ('VAL' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('VAL' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('TRP' , '1HD' ) : { 'type' : 'H4' , 'charge' : 0.2062 } , ('TRP' , '1HE' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3412 } , ('TRP' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0339 } , ('TRP' , '2HH' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1417 } , ('TRP' , '2HZ' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1572 } , ('TRP' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0339 } , ('TRP' , '3HE' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1700 } , ('TRP' , '3HZ' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1447 } , ('TRP' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('TRP' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0275 } , ('TRP' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0050 } , ('TRP' , 'CD1' ) : { 'type' : 'CW' , 'charge' : -0.1638 } , ('TRP' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CB' , 'charge' : 0.1243 } , ('TRP' , 'CE2' ) : { 'type' : 'CN' , 'charge' : 0.1380 } , ('TRP' , 'CE3' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.2387 } , ('TRP' , 'CG' ) : { 'type' : 'C*' , 'charge' : -0.1415 } , ('TRP' , 'CH2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1134 } , ('TRP' , 'CZ2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.2601 } , ('TRP' , 'CZ3' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1972 } , ('TRP' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('TRP' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1123 } , ('TRP' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('TRP' , 'NE1' ) : { 'type' : 'NA' , 'charge' : -0.3418 } , ('TRP' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('TYR' , '1HD' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1699 } , ('TYR' , '1HE' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1656 } , ('TYR' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0295 } , ('TYR' , '2HD' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1699 } , ('TYR' , '2HE' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1656 } , ('TYR' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0295 } , ('TYR' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5973 } , ('TYR' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0014 } , ('TYR' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0152 } , ('TYR' , 'CD1' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1906 } , ('TYR' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1906 } , ('TYR' , 'CE1' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.2341 } , ('TYR' , 'CE2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.2341 } , ('TYR' , 'CG' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.0011 } , ('TYR' , 'CZ' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : 0.3226 } , # WLD C->CA ('TYR' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('TYR' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0876 } , ('TYR' , 'HH' ) : { 'type' : 'HO' , 'charge' : 0.3992 } , ('TYR' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('TYR' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , ('TYR' , 'OH' ) : { 'type' : 'OH' , 'charge' : -0.5579 } , ('NME' , '1HH3' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0976 } , ('NME' , '2HH3' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0976 } , ('NME' , '3HH3' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0976 } , ('NME' , 'CH3' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1490 } , ('NME' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2719 } , ('NME' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.4157 } , ('ACE' , '1HH3' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1123 } , ('ACE' , '2HH3' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1123 } , ('ACE' , '3HH3' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1123 } , ('ACE' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5972 } , ('ACE' , 'CH3' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.3662 } , ('ACE' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5679 } , } n_terminal = { ('ALA' , '1HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0300 } , ('ALA' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1997 } , ('ALA' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0300 } , ('ALA' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1997 } , ('ALA' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0300 } , ('ALA' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1997 } , ('ALA' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6163 } , ('ALA' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0962 } , ('ALA' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0597 } , ('ALA' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.0889 } , ('ALA' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.1414 } , ('ALA' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5722 } , ('CYS' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2023 } , ('CYS' , '2HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1188 } , ('CYS' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2023 } , ('CYS' , '3HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1188 } , ('CYS' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2023 } , ('CYS' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6123 } , ('CYS' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0927 } , ('CYS' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1195 } , ('CYS' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1411 } , ('CYS' , 'HG' ) : { 'type' : 'HS' , 'charge' : 0.1975 } , ('CYS' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.1325 } , ('CYS' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5713 } , ('CYS' , 'SG' ) : { 'type' : 'SH' , 'charge' : -0.3298 } , ('CYX' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1815 } , ('CYX' , '2HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0680 } , ('CYX' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1815 } , ('CYX' , '3HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0680 } , ('CYX' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1815 } , ('CYX' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6123 } , ('CYX' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.1055 } , ('CYX' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0277 } , ('CYX' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.0922 } , ('CYX' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.2069 } , ('CYX' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5713 } , ('CYX' , 'SG' ) : { 'type' : 'S' , 'charge' : -0.0984 } , ('ASP' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2200 } , ('ASP' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0169 } , ('ASP' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2200 } , ('ASP' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0169 } , ('ASP' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2200 } , ('ASP' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5621 } , ('ASP' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0292 } , ('ASP' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0235 } , ('ASP' , 'CG' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8194 } , ('ASP' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1141 } , ('ASP' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.0782 } , ('ASP' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5889 } , ('ASP' , 'OD1' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8084 } , ('ASP' , 'OD2' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8084 } , ('ASH' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2200 } , ('ASH' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0169 } , ('ASH' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2200 } , ('ASH' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0169 } , ('ASH' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2200 } , ('ASH' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5621 } , ('ASH' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0292 } , ('ASH' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0235 } , ('ASH' , 'CG' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8194 } , ('ASH' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1141 } , ('ASH' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.0782 } , ('ASH' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5889 } , ('ASH' , 'OD1' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.8084 } , ('ASH' , 'OD2' ) : { 'type' : 'OH' , 'charge' : -0.8084 } , ('GLU' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2391 } , ('GLU' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0232 } , ('GLU' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0315 } , ('GLU' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2391 } , ('GLU' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0232 } , ('GLU' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0315 } , ('GLU' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2391 } , ('GLU' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5621 } , ('GLU' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0588 } , ('GLU' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0909 } , ('GLU' , 'CD' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8087 } , ('GLU' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0236 } , ('GLU' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1202 } , ('GLU' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.0017 } , ('GLU' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5889 } , ('GLU' , 'OE1' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8189 } , ('GLU' , 'OE2' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8189 } , ('GLP' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2391 } , ('GLP' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0232 } , ('GLP' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0315 } , ('GLP' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2391 } , ('GLP' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0232 } , ('GLP' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0315 } , ('GLP' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2391 } , ('GLP' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5621 } , ('GLP' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0588 } , ('GLP' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0909 } , ('GLP' , 'CD' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8087 } , ('GLP' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0236 } , ('GLP' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1202 } , ('GLP' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.0017 } , ('GLP' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5889 } , ('GLP' , 'OE1' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.8189 } , ('GLP' , 'OE2' ) : { 'type' : 'OH' , 'charge' : -0.8189 } , ('PHE' , '1HD' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1374 } , ('PHE' , '1HE' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1433 } , ('PHE' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1921 } , ('PHE' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0104 } , ('PHE' , '2HD' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1374 } , ('PHE' , '2HE' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1433 } , ('PHE' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1921 } , ('PHE' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0104 } , ('PHE' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1921 } , ('PHE' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6123 } , ('PHE' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0733 } , ('PHE' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0330 } , ('PHE' , 'CD1' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1392 } , ('PHE' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1391 } , ('PHE' , 'CE1' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1602 } , ('PHE' , 'CE2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1603 } , ('PHE' , 'CG' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : 0.0031 } , ('PHE' , 'CZ' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1208 } , ('PHE' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1041 } , ('PHE' , 'HZ' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1329 } , ('PHE' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.1737 } , ('PHE' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5713 } , ('GLY' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1642 } , ('GLY' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1642 } , ('GLY' , '3HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0895 } , ('GLY' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1642 } , ('GLY' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6163 } , ('GLY' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0100 } , ('GLY' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.0895 } , ('GLY' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.2943 } , ('GLY' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5722 } , ('HIP' , '1HD' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3821 } , ('HIP' , '1HE' ) : { 'type' : 'H5' , 'charge' : 0.2645 } , ('HIP' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1704 } , ('HIP' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0531 } , ('HIP' , '2HD' ) : { 'type' : 'H4' , 'charge' : 0.2495 } , ('HIP' , '2HE' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3921 } , ('HIP' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1704 } , ('HIP' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0531 } , ('HIP' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1704 } , ('HIP' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7214 } , ('HIP' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0581 } , ('HIP' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0484 } , ('HIP' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CW' , 'charge' : -0.1433 } , ('HIP' , 'CE1' ) : { 'type' : 'CR' , 'charge' : -0.0011 } , ('HIP' , 'CG' ) : { 'type' : 'CC' , 'charge' : -0.0236 } , ('HIP' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1047 } , ('HIP' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.2560 } , ('HIP' , 'ND1' ) : { 'type' : 'NA' , 'charge' : -0.1510 } , ('HIP' , 'NE2' ) : { 'type' : 'NA' , 'charge' : -0.1739 } , ('HIP' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.6013 } , ('HIE' , '1HE' ) : { 'type' : 'H5' , 'charge' : 0.1397 } , ('HIE' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2016 } , ('HIE' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0223 } , ('HIE' , '2HD' ) : { 'type' : 'H4' , 'charge' : 0.1963 } , ('HIE' , '2HE' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3324 } , ('HIE' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2016 } , ('HIE' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0223 } , ('HIE' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2016 } , ('HIE' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6123 } , ('HIE' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0236 } , ('HIE' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0489 } , ('HIE' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CW' , 'charge' : -0.2349 } , ('HIE' , 'CE1' ) : { 'type' : 'CR' , 'charge' : 0.1804 } , ('HIE' , 'CG' ) : { 'type' : 'CC' , 'charge' : 0.1740 } , ('HIE' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1380 } , ('HIE' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.1472 } , ('HIE' , 'ND1' ) : { 'type' : 'NB' , 'charge' : -0.5579 } , ('HIE' , 'NE2' ) : { 'type' : 'NA' , 'charge' : -0.2781 } , ('HIE' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5713 } , ('HID' , '1HD' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3632 } , ('HID' , '1HE' ) : { 'type' : 'H5' , 'charge' : 0.1385 } , ('HID' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1963 } , ('HID' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0209 } , ('HID' , '2HD' ) : { 'type' : 'H4' , 'charge' : 0.1299 } , ('HID' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1963 } , ('HID' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0209 } , ('HID' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1963 } , ('HID' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6123 } , ('HID' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0964 } , ('HID' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0259 } , ('HID' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CV' , 'charge' : 0.1046 } , ('HID' , 'CE1' ) : { 'type' : 'CR' , 'charge' : 0.2127 } , ('HID' , 'CG' ) : { 'type' : 'CC' , 'charge' : -0.0399 } , ('HID' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.0958 } , ('HID' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.1542 } , ('HID' , 'ND1' ) : { 'type' : 'NA' , 'charge' : -0.3819 } , ('HID' , 'NE2' ) : { 'type' : 'NB' , 'charge' : -0.5711 } , ('HID' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5713 } , ('ILE' , '1HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0226 } , ('ILE' , '1HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0947 } , ('ILE' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2329 } , ('ILE' , '2HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0226 } , ('ILE' , '2HG1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0201 } , ('ILE' , '2HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0947 } , ('ILE' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2329 } , ('ILE' , '3HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0226 } , ('ILE' , '3HG1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0201 } , ('ILE' , '3HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0947 } , ('ILE' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2329 } , ('ILE' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6123 } , ('ILE' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0257 } , ('ILE' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.1885 } , ('ILE' , 'CD1' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0908 } , ('ILE' , 'CG1' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0387 } , ('ILE' , 'CG2' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.3720 } , ('ILE' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1031 } , ('ILE' , 'HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0213 } , ('ILE' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.0311 } , ('ILE' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5713 } , ('LYS' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2165 } , ('LYS' , '1HZ' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3382 } , ('LYS' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0283 } , ('LYS' , '2HD' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0633 } , ('LYS' , '2HE' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1171 } , ('LYS' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0121 } , ('LYS' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2165 } , ('LYS' , '2HZ' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3382 } , ('LYS' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0283 } , ('LYS' , '3HD' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0633 } , ('LYS' , '3HE' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1171 } , ('LYS' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0121 } , ('LYS' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2165 } , ('LYS' , '3HZ' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3382 } , ('LYS' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7214 } , ('LYS' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0015 } , ('LYS' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0212 } , ('LYS' , 'CD' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0608 } , ('LYS' , 'CE' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0181 } , ('LYS' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0048 } , ('LYS' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1180 } , ('LYS' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.0966 } , ('LYS' , 'NZ' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : -0.3764 } , ('LYS' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.6013 } , ('LEU' , '1HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0980 } , ('LEU' , '1HD2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0980 } , ('LEU' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2148 } , ('LEU' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0256 } , ('LEU' , '2HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0980 } , ('LEU' , '2HD2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0980 } , ('LEU' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2148 } , ('LEU' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0256 } , ('LEU' , '3HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0980 } , ('LEU' , '3HD2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0980 } , ('LEU' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2148 } , ('LEU' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6123 } , ('LEU' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0104 } , ('LEU' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0244 } , ('LEU' , 'CD1' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.4106 } , ('LEU' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.4104 } , ('LEU' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.3421 } , ('LEU' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1053 } , ('LEU' , 'HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0380 } , ('LEU' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.1010 } , ('LEU' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5713 } , ('MET' , '1HE' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0597 } , ('MET' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1984 } , ('MET' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0125 } , ('MET' , '2HE' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0597 } , ('MET' , '2HG' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0292 } , ('MET' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1984 } , ('MET' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0125 } , ('MET' , '3HE' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0597 } , ('MET' , '3HG' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0292 } , ('MET' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1984 } , ('MET' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6123 } , ('MET' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0221 } , ('MET' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0865 } , ('MET' , 'CE' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0341 } , ('MET' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0334 } , ('MET' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1116 } , ('MET' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.1592 } , ('MET' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5713 } , ('MET' , 'SD' ) : { 'type' : 'S' , 'charge' : -0.2774 } , ('ASN' , '1HD2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4097 } , ('ASN' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1921 } , ('ASN' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0515 } , ('ASN' , '2HD2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4097 } , ('ASN' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1921 } , ('ASN' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0515 } , ('ASN' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1921 } , ('ASN' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6163 } , ('ASN' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0368 } , ('ASN' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0283 } , ('ASN' , 'CG' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5833 } , ('ASN' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1231 } , ('ASN' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.1801 } , ('ASN' , 'ND2' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.8634 } , ('ASN' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5722 } , ('ASN' , 'OD1' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5744 } , ('PRO' , '2H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3120 } , ('PRO' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1000 } , ('PRO' , '2HD' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1000 } , ('PRO' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1000 } , ('PRO' , '3H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3120 } , ('PRO' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1000 } , ('PRO' , '3HD' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1000 } , ('PRO' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1000 } , ('PRO' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.5260 } , ('PRO' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.1000 } , ('PRO' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1150 } , ('PRO' , 'CD' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0120 } , ('PRO' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1210 } , ('PRO' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1000 } , ('PRO' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : -0.2020 } , ('PRO' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5000 } , ('GLN' , '1HE2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4429 } , ('GLN' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1996 } , ('GLN' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0050 } , ('GLN' , '2HE2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4429 } , ('GLN' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0331 } , ('GLN' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1996 } , ('GLN' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0050 } , ('GLN' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0331 } , ('GLN' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1996 } , ('GLN' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6123 } , ('GLN' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0536 } , ('GLN' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0651 } , ('GLN' , 'CD' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7354 } , ('GLN' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0903 } , ('GLN' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1015 } , ('GLN' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.1493 } , ('GLN' , 'NE2' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -1.0031 } , ('GLN' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5713 } , ('GLN' , 'OE1' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.6133 } , ('ARG' , '1HH1' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4494 } , ('ARG' , '1HH2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4494 } , ('ARG' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2083 } , ('ARG' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0226 } , ('ARG' , '2HD' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0527 } , ('ARG' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0309 } , ('ARG' , '2HH1' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4494 } , ('ARG' , '2HH2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4494 } , ('ARG' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2083 } , ('ARG' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0226 } , ('ARG' , '3HD' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0527 } , ('ARG' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0309 } , ('ARG' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2083 } , ('ARG' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7214 } , ('ARG' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0223 } , ('ARG' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0118 } , ('ARG' , 'CD' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0935 } , ('ARG' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0236 } , ('ARG' , 'CZ' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : 0.8281 } , ('ARG' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1242 } , ('ARG' , 'HE' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3592 } , ('ARG' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.1305 } , ('ARG' , 'NE' ) : { 'type' : 'N2' , 'charge' : -0.5650 } , ('ARG' , 'NH1' ) : { 'type' : 'N2' , 'charge' : -0.8693 } , ('ARG' , 'NH2' ) : { 'type' : 'N2' , 'charge' : -0.8693 } , ('ARG' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.6013 } , ('SER' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1898 } , ('SER' , '2HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0273 } , ('SER' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1898 } , ('SER' , '3HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0273 } , ('SER' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1898 } , ('SER' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6163 } , ('SER' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0567 } , ('SER' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.2596 } , ('SER' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.0782 } , ('SER' , 'HG' ) : { 'type' : 'HO' , 'charge' : 0.4239 } , ('SER' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.1849 } , ('SER' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5722 } , ('SER' , 'OG' ) : { 'type' : 'OH' , 'charge' : -0.6714 } , ('THR' , '1HG' ) : { 'type' : 'HO' , 'charge' : 0.4070 } , ('THR' , '1HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0627 } , ('THR' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1934 } , ('THR' , '2HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0627 } , ('THR' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1934 } , ('THR' , '3HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0627 } , ('THR' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1934 } , ('THR' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6163 } , ('THR' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0034 } , ('THR' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.4514 } , ('THR' , 'CG2' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2554 } , ('THR' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1087 } , ('THR' , 'HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : -0.0323 } , ('THR' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.1812 } , ('THR' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5722 } , ('THR' , 'OG1' ) : { 'type' : 'OH' , 'charge' : -0.6764 } , ('VAL' , '1HG1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0735 } , ('VAL' , '1HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0735 } , ('VAL' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2272 } , ('VAL' , '2HG1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0735 } , ('VAL' , '2HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0735 } , ('VAL' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2272 } , ('VAL' , '3HG1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0735 } , ('VAL' , '3HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0735 } , ('VAL' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2272 } , ('VAL' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6163 } , ('VAL' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0054 } , ('VAL' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.3196 } , ('VAL' , 'CG1' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.3129 } , ('VAL' , 'CG2' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.3129 } , ('VAL' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1093 } , ('VAL' , 'HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0221 } , ('VAL' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.0577 } , ('VAL' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5722 } , ('TRP' , '1HD' ) : { 'type' : 'H4' , 'charge' : 0.2195 } , ('TRP' , '1HE' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3412 } , ('TRP' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1888 } , ('TRP' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0222 } , ('TRP' , '2HH' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1411 } , ('TRP' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1888 } , ('TRP' , '2HZ' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1589 } , ('TRP' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0222 } , ('TRP' , '3HE' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1646 } , ('TRP' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1888 } , ('TRP' , '3HZ' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1458 } , ('TRP' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6123 } , ('TRP' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0421 } , ('TRP' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0543 } , ('TRP' , 'CD1' ) : { 'type' : 'CW' , 'charge' : -0.1788 } , ('TRP' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CB' , 'charge' : 0.1132 } , ('TRP' , 'CE2' ) : { 'type' : 'CN' , 'charge' : 0.1575 } , ('TRP' , 'CE3' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.2265 } , ('TRP' , 'CG' ) : { 'type' : 'C*' , 'charge' : -0.1654 } , ('TRP' , 'CH2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1080 } , ('TRP' , 'CZ2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.2710 } , ('TRP' , 'CZ3' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.2034 } , ('TRP' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1162 } , ('TRP' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.1913 } , ('TRP' , 'NE1' ) : { 'type' : 'NA' , 'charge' : -0.3444 } , ('TRP' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5713 } , ('TYR' , '1HD' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1720 } , ('TYR' , '1HE' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1650 } , ('TYR' , '1HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1873 } , ('TYR' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0102 } , ('TYR' , '2HD' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1720 } , ('TYR' , '2HE' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1650 } , ('TYR' , '2HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1873 } , ('TYR' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0102 } , ('TYR' , '3HT' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.1873 } , ('TYR' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6123 } , ('TYR' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0570 } , ('TYR' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0659 } , ('TYR' , 'CD1' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.2002 } , ('TYR' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.2002 } , ('TYR' , 'CE1' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.2239 } , ('TYR' , 'CE2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.2239 } , ('TYR' , 'CG' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.0205 } , ('TYR' , 'CZ' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : 0.3139 } , # WLD C->CA ('TYR' , 'HA' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.0983 } , ('TYR' , 'HH' ) : { 'type' : 'HO' , 'charge' : 0.4001 } , ('TYR' , 'N' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : 0.1940 } , ('TYR' , 'O' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.5713 } , ('TYR' , 'OH' ) : { 'type' : 'OH' , 'charge' : -0.5578 } , } c_terminal = { ('ALA' , '1HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0764 } , ('ALA' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0764 } , ('ALA' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0764 } , ('ALA' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7731 } , ('ALA' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1747 } , ('ALA' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2093 } , ('ALA' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2681 } , ('ALA' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1067 } , ('ALA' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3821 } , ('ALA' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8055 } , ('ALA' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8055 } , ('CYS' , '2HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1437 } , ('CYS' , '3HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1437 } , ('CYS' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7497 } , ('CYS' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1635 } , ('CYS' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1996 } , ('CYS' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2681 } , ('CYS' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1396 } , ('CYS' , 'HG' ) : { 'type' : 'HS' , 'charge' : 0.2068 } , ('CYS' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3821 } , ('CYS' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.7981 } , ('CYS' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.7981 } , ('CYS' , 'SG' ) : { 'type' : 'SH' , 'charge' : -0.3102 } , ('CYX' , '2HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1228 } , ('CYX' , '3HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1228 } , ('CYX' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7618 } , ('CYX' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1318 } , ('CYX' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1943 } , ('CYX' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2681 } , ('CYX' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0938 } , ('CYX' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3821 } , ('CYX' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8041 } , ('CYX' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8041 } , ('CYX' , 'SG' ) : { 'type' : 'S' , 'charge' : -0.0529 } , ('ASP' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0212 } , ('ASP' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0212 } , ('ASP' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7256 } , ('ASP' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1817 } , ('ASP' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0677 } , ('ASP' , 'CG' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8851 } , ('ASP' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3055 } , ('ASP' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1046 } , ('ASP' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.5192 } , ('ASP' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.7887 } , ('ASP' , 'OD1' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8162 } , ('ASP' , 'OD2' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8162 } , ('ASP' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.7887 } , ('ASH' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0212 } , ('ASH' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0212 } , ('ASH' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7256 } , ('ASH' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1817 } , ('ASH' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0677 } , ('ASH' , 'CG' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8851 } , ('ASH' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3055 } , ('ASH' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1046 } , ('ASH' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.5192 } , ('ASH' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.7887 } , ('ASH' , 'OD1' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.8162 } , ('ASH' , 'OD2' ) : { 'type' : 'OH' , 'charge' : -0.8162 } , ('ASH' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.7887 } , ('GLU' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0078 } , ('GLU' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0548 } , ('GLU' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0078 } , ('GLU' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0548 } , ('GLU' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7420 } , ('GLU' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2059 } , ('GLU' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0071 } , ('GLU' , 'CD' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8183 } , ('GLU' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0675 } , ('GLU' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3055 } , ('GLU' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1399 } , ('GLU' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.5192 } , ('GLU' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.7930 } , ('GLU' , 'OE1' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8220 } , ('GLU' , 'OE2' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8220 } , ('GLU' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.7930 } , ('GLP' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0078 } , ('GLP' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0548 } , ('GLP' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0078 } , ('GLP' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0548 } , ('GLP' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7420 } , ('GLP' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2059 } , ('GLP' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0071 } , ('GLP' , 'CD' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8183 } , ('GLP' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0675 } , ('GLP' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3055 } , ('GLP' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1399 } , ('GLP' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.5192 } , ('GLP' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.7930 } , ('GLP' , 'OE1' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.8220 } , ('GLP' , 'OE2' ) : { 'type' : 'OH' , 'charge' : -0.8220 } , ('GLP' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.7930 } , ('PHE' , '1HD' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1408 } , ('PHE' , '1HE' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1461 } , ('PHE' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0443 } , ('PHE' , '2HD' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1408 } , ('PHE' , '2HE' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1461 } , ('PHE' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0443 } , ('PHE' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7660 } , ('PHE' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1825 } , ('PHE' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0959 } , ('PHE' , 'CD1' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1300 } , ('PHE' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1300 } , ('PHE' , 'CE1' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1847 } , ('PHE' , 'CE2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1847 } , ('PHE' , 'CG' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : 0.0552 } , ('PHE' , 'CZ' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.0944 } , ('PHE' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2681 } , ('PHE' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1098 } , ('PHE' , 'HZ' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1280 } , ('PHE' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3821 } , ('PHE' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8026 } , ('PHE' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8026 } , ('GLY' , '3HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1056 } , ('GLY' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7231 } , ('GLY' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2493 } , ('GLY' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2681 } , ('GLY' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1056 } , ('GLY' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3821 } , ('GLY' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.7855 } , ('GLY' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.7855 } , ('HIP' , '1HD' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3883 } , ('HIP' , '1HE' ) : { 'type' : 'H5' , 'charge' : 0.2694 } , ('HIP' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0868 } , ('HIP' , '2HD' ) : { 'type' : 'H4' , 'charge' : 0.2336 } , ('HIP' , '2HE' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3913 } , ('HIP' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0868 } , ('HIP' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8032 } , ('HIP' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1445 } , ('HIP' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0800 } , ('HIP' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CW' , 'charge' : -0.1256 } , ('HIP' , 'CE1' ) : { 'type' : 'CR' , 'charge' : -0.0251 } , ('HIP' , 'CG' ) : { 'type' : 'CC' , 'charge' : 0.0298 } , ('HIP' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2764 } , ('HIP' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1115 } , ('HIP' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3481 } , ('HIP' , 'ND1' ) : { 'type' : 'NA' , 'charge' : -0.1501 } , ('HIP' , 'NE2' ) : { 'type' : 'NA' , 'charge' : -0.1683 } , ('HIP' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8177 } , ('HIP' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8177 } , ('HIE' , '1HE' ) : { 'type' : 'H5' , 'charge' : 0.1448 } , ('HIE' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0620 } , ('HIE' , '2HD' ) : { 'type' : 'H4' , 'charge' : 0.1957 } , ('HIE' , '2HE' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3319 } , ('HIE' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0620 } , ('HIE' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7916 } , ('HIE' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2699 } , ('HIE' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1068 } , ('HIE' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CW' , 'charge' : -0.2588 } , ('HIE' , 'CE1' ) : { 'type' : 'CR' , 'charge' : 0.1558 } , ('HIE' , 'CG' ) : { 'type' : 'CC' , 'charge' : 0.2724 } , ('HIE' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2681 } , ('HIE' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1650 } , ('HIE' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3821 } , ('HIE' , 'ND1' ) : { 'type' : 'NB' , 'charge' : -0.5517 } , ('HIE' , 'NE2' ) : { 'type' : 'NA' , 'charge' : -0.2670 } , ('HIE' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8065 } , ('HIE' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8065 } , ('HID' , '1HD' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3755 } , ('HID' , '1HE' ) : { 'type' : 'H5' , 'charge' : 0.1418 } , ('HID' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0565 } , ('HID' , '2HD' ) : { 'type' : 'H4' , 'charge' : 0.1241 } , ('HID' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0565 } , ('HID' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7615 } , ('HID' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1739 } , ('HID' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1046 } , ('HID' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CV' , 'charge' : 0.1001 } , ('HID' , 'CE1' ) : { 'type' : 'CR' , 'charge' : 0.1925 } , ('HID' , 'CG' ) : { 'type' : 'CC' , 'charge' : 0.0293 } , ('HID' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2681 } , ('HID' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1100 } , ('HID' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3821 } , ('HID' , 'ND1' ) : { 'type' : 'NA' , 'charge' : -0.3892 } , ('HID' , 'NE2' ) : { 'type' : 'NB' , 'charge' : -0.5629 } , ('HID' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8016 } , ('HID' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8016 } , ('ILE' , '1HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0196 } , ('ILE' , '1HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1021 } , ('ILE' , '2HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0196 } , ('ILE' , '2HG1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0321 } , ('ILE' , '2HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1021 } , ('ILE' , '3HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0196 } , ('ILE' , '3HG1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0321 } , ('ILE' , '3HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1021 } , ('ILE' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8343 } , ('ILE' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.3100 } , ('ILE' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0363 } , ('ILE' , 'CD1' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0699 } , ('ILE' , 'CG1' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0323 } , ('ILE' , 'CG2' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.3498 } , ('ILE' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2681 } , ('ILE' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1375 } , ('ILE' , 'HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0766 } , ('ILE' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3821 } , ('ILE' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8190 } , ('ILE' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8190 } , ('LYS' , '1HZ' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3374 } , ('LYS' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0482 } , ('LYS' , '2HD' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0611 } , ('LYS' , '2HE' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1121 } , ('LYS' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0134 } , ('LYS' , '2HZ' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3374 } , ('LYS' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0482 } , ('LYS' , '3HD' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0611 } , ('LYS' , '3HE' ) : { 'type' : 'HP' , 'charge' : 0.1121 } , ('LYS' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0134 } , ('LYS' , '3HZ' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3374 } , ('LYS' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8488 } , ('LYS' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2903 } , ('LYS' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0538 } , ('LYS' , 'CD' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0392 } , ('LYS' , 'CE' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0176 } , ('LYS' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0227 } , ('LYS' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2764 } , ('LYS' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1438 } , ('LYS' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3481 } , ('LYS' , 'NZ' ) : { 'type' : 'N3' , 'charge' : -0.3741 } , ('LYS' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8252 } , ('LYS' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8252 } , ('LEU' , '1HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1038 } , ('LEU' , '1HD2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1038 } , ('LEU' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0974 } , ('LEU' , '2HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1038 } , ('LEU' , '2HD2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1038 } , ('LEU' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0974 } , ('LEU' , '3HD1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1038 } , ('LEU' , '3HD2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1038 } , ('LEU' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8326 } , ('LEU' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2847 } , ('LEU' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2469 } , ('LEU' , 'CD1' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.4163 } , ('LEU' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.4163 } , ('LEU' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.3706 } , ('LEU' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2681 } , ('LEU' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1346 } , ('LEU' , 'HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : -0.0374 } , ('LEU' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3821 } , ('LEU' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8199 } , ('LEU' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8199 } , ('MET' , '1HE' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0625 } , ('MET' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0480 } , ('MET' , '2HE' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0625 } , ('MET' , '2HG' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0317 } , ('MET' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0480 } , ('MET' , '3HE' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0625 } , ('MET' , '3HG' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0317 } , ('MET' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8013 } , ('MET' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2597 } , ('MET' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0236 } , ('MET' , 'CE' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0376 } , ('MET' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0492 } , ('MET' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2681 } , ('MET' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1277 } , ('MET' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3821 } , ('MET' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8105 } , ('MET' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8105 } , ('MET' , 'SD' ) : { 'type' : 'S' , 'charge' : -0.2692 } , ('ASN' , '1HD2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4150 } , ('ASN' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1023 } , ('ASN' , '2HD2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4150 } , ('ASN' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.1023 } , ('ASN' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8050 } , ('ASN' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2080 } , ('ASN' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2299 } , ('ASN' , 'CG' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7153 } , ('ASN' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2681 } , ('ASN' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1358 } , ('ASN' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3821 } , ('ASN' , 'ND2' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.9084 } , ('ASN' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8147 } , ('ASN' , 'OD1' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.6010 } , ('ASN' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8147 } , ('PRO' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0381 } , ('PRO' , '2HD' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0331 } , ('PRO' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0172 } , ('PRO' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0381 } , ('PRO' , '3HD' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0331 } , ('PRO' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0172 } , ('PRO' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.6631 } , ('PRO' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1336 } , ('PRO' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0543 } , ('PRO' , 'CD' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0434 } , ('PRO' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0466 } , ('PRO' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0776 } , ('PRO' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.2802 } , ('PRO' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.7697 } , ('PRO' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.7697 } , ('GLN' , '1HE2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4304 } , ('GLN' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0452 } , ('GLN' , '2HE2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4304 } , ('GLN' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0203 } , ('GLN' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0452 } , ('GLN' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0203 } , ('GLN' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7775 } , ('GLN' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2248 } , ('GLN' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0664 } , ('GLN' , 'CD' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7093 } , ('GLN' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0210 } , ('GLN' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2681 } , ('GLN' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1232 } , ('GLN' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3821 } , ('GLN' , 'NE2' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.9574 } , ('GLN' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8042 } , ('GLN' , 'OE1' ) : { 'type' : 'O' , 'charge' : -0.6098 } , ('GLN' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8042 } , ('ARG' , '1HH1' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4493 } , ('ARG' , '1HH2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4493 } , ('ARG' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0371 } , ('ARG' , '2HD' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0468 } , ('ARG' , '2HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0185 } , ('ARG' , '2HH1' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4493 } , ('ARG' , '2HH2' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.4493 } , ('ARG' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0371 } , ('ARG' , '3HD' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0468 } , ('ARG' , '3HG' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0185 } , ('ARG' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8557 } , ('ARG' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.3068 } , ('ARG' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0374 } , ('ARG' , 'CD' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.1114 } , ('ARG' , 'CG' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.0744 } , ('ARG' , 'CZ' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : 0.8368 } , ('ARG' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2764 } , ('ARG' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1447 } , ('ARG' , 'HE' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3479 } , ('ARG' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3481 } , ('ARG' , 'NE' ) : { 'type' : 'N2' , 'charge' : -0.5564 } , ('ARG' , 'NH1' ) : { 'type' : 'N2' , 'charge' : -0.8737 } , ('ARG' , 'NH2' ) : { 'type' : 'N2' , 'charge' : -0.8737 } , ('ARG' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8266 } , ('ARG' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8266 } , ('SER' , '2HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0813 } , ('SER' , '3HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0813 } , ('SER' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8113 } , ('SER' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2722 } , ('SER' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.1123 } , ('SER' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2681 } , ('SER' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1304 } , ('SER' , 'HG' ) : { 'type' : 'HO' , 'charge' : 0.4474 } , ('SER' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3821 } , ('SER' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8132 } , ('SER' , 'OG' ) : { 'type' : 'OH' , 'charge' : -0.6514 } , ('SER' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8132 } , ('THR' , '1HG' ) : { 'type' : 'HO' , 'charge' : 0.4119 } , ('THR' , '1HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0586 } , ('THR' , '2HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0586 } , ('THR' , '3HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0586 } , ('THR' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7810 } , ('THR' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2420 } , ('THR' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.3025 } , ('THR' , 'CG2' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.1853 } , ('THR' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2681 } , ('THR' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1207 } , ('THR' , 'HB' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.0078 } , ('THR' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3821 } , ('THR' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8044 } , ('THR' , 'OG1' ) : { 'type' : 'OH' , 'charge' : -0.6496 } , ('THR' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8044 } , ('VAL' , '1HG1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0836 } , ('VAL' , '1HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0836 } , ('VAL' , '2HG1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0836 } , ('VAL' , '2HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0836 } , ('VAL' , '3HG1' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0836 } , ('VAL' , '3HG2' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0836 } , ('VAL' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.8350 } , ('VAL' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.3438 } , ('VAL' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : 0.1940 } , ('VAL' , 'CG1' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.3064 } , ('VAL' , 'CG2' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.3064 } , ('VAL' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2681 } , ('VAL' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1438 } , ('VAL' , 'HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0308 } , ('VAL' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3821 } , ('VAL' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8173 } , ('VAL' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8173 } , ('TRP' , '1HD' ) : { 'type' : 'H4' , 'charge' : 0.2043 } , ('TRP' , '1HE' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.3413 } , ('TRP' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0497 } , ('TRP' , '2HH' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1401 } , ('TRP' , '2HZ' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1567 } , ('TRP' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0497 } , ('TRP' , '3HE' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1491 } , ('TRP' , '3HZ' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1507 } , ('TRP' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7658 } , ('TRP' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2084 } , ('TRP' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0742 } , ('TRP' , 'CD1' ) : { 'type' : 'CW' , 'charge' : -0.1808 } , ('TRP' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CB' , 'charge' : 0.1078 } , ('TRP' , 'CE2' ) : { 'type' : 'CN' , 'charge' : 0.1222 } , ('TRP' , 'CE3' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1837 } , ('TRP' , 'CG' ) : { 'type' : 'C*' , 'charge' : -0.0796 } , ('TRP' , 'CH2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1020 } , ('TRP' , 'CZ2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.2594 } , ('TRP' , 'CZ3' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.2287 } , ('TRP' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2681 } , ('TRP' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1272 } , ('TRP' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3821 } , ('TRP' , 'NE1' ) : { 'type' : 'NA' , 'charge' : -0.3316 } , ('TRP' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8011 } , ('TRP' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8011 } , ('TYR' , '1HD' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1780 } , ('TYR' , '1HE' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1673 } , ('TYR' , '2HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0490 } , ('TYR' , '2HD' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1780 } , ('TYR' , '2HE' ) : { 'type' : 'HA' , 'charge' : 0.1673 } , ('TYR' , '3HB' ) : { 'type' : 'HC' , 'charge' : 0.0490 } , ('TYR' , 'C' ) : { 'type' : 'C' , 'charge' : 0.7817 } , ('TYR' , 'CA' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.2015 } , ('TYR' , 'CB' ) : { 'type' : 'CT' , 'charge' : -0.0752 } , ('TYR' , 'CD1' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1922 } , ('TYR' , 'CD2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.1922 } , ('TYR' , 'CE1' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.2458 } , ('TYR' , 'CE2' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : -0.2458 } , ('TYR' , 'CG' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : 0.0243 } , ('TYR' , 'CZ' ) : { 'type' : 'CA' , 'charge' : 0.3395 } , # WLD C->CA ('TYR' , 'H' ) : { 'type' : 'H' , 'charge' : 0.2681 } , ('TYR' , 'HA' ) : { 'type' : 'H1' , 'charge' : 0.1092 } , ('TYR' , 'HH' ) : { 'type' : 'HO' , 'charge' : 0.4017 } , ('TYR' , 'N' ) : { 'type' : 'N' , 'charge' : -0.3821 } , ('TYR' , 'O' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8070 } , ('TYR' , 'OH' ) : { 'type' : 'OH' , 'charge' : -0.5643 } , ('TYR' , 'OXT' ) : { 'type' : 'O2' , 'charge' : -0.8070 } , }